از نظر خط مشی فکری، طرفداران ملا یعقوب او را به شاخه جریان میانهرو طالبان نسبت میدهند. ادعا میشود که او از حل و فصل جنگ در افغانستان از طریق مذاکره حمایت کرده و از حامیان پرشور رهبر سابق طالبان اختر منصور است
رسانههای افغانستان از سوءقصد به جان «مولوی محمد یعقوب مجاهد» در ننگرهار طی یک حمله انتحاری خبر دادند .
سخنگوی امارت اسلامی از دیدار مولوی محمد یعقوب مجاهد، سرپرست وزارت دفاع ملی امارت اسلامی در حاشیه سفر حج، با محمد بن سلمان، ولی عهد عربستان سعودی خبر داده است.